公报显示：２００７年江苏省内淮河干流水质总体仅达到地表水环境质量Ⅳ类标准。在４ ５个国家考核断面中，有３６个断面水质达标，达标率８０．０％。南水北调东线江苏段１４个控制断面中，有１１个断面水质达到地表水环境质量Ⅲ类标准，达标率７８．６％。

    洪泽湖是淮河流域最大的泄洪蓄水湖泊，是苏北地区的重要水源。２００７年，洪泽湖湖体高锰酸盐指数达到地表水环境质量Ⅱ类标准，受总磷和总氮影响，湖体处于轻度富营养状态。

    京杭大运河流经江苏省８个省辖市。８个城市河段中，徐州段、宿迁段、淮安段和扬州段水质达到地表水环境质量Ⅲ类标准，镇江段和常州段水质达Ⅳ类，无锡段和苏州段水质劣于Ⅴ类。

    太湖湖体高锰酸盐指数达到地表水环境质量Ⅲ类标准，总磷平均浓度达到Ⅳ类标准，总氮平均浓度劣于Ⅴ类。全湖富营养化程度平均为中富营养，其中湖心区和东部沿岸区处于轻富营养化水平，其余湖区均处于中富营养水平。

    根据《江苏省“十一五”水污染物总量削减目标责任书（２００６－２０１０年）》确定的水质目标要求，太湖流域５３个水质目标考核断面中有２１个断面达标，达标率３９．６％；其中主要考核指标高锰酸盐指数、总磷和氨氮达标率分别为６６．０％、６０．４％和５８．５％。

    ２００７年３月下旬开始，太湖出现蓝藻水华；５月份，蓝藻水华暴发。卫星遥感监测表明，２００７年太湖蓝藻水华在梅梁湖、贡湖、竺山湖和太湖西部发生较频繁。